Joana Amorim é especializada na interpretação de flautas históricas, tocando regularmente vários traverssos do século XVI ao início do século XIX, bem como flauta de bisel.

O seu interesse pela música e cultura indianas levaram-na também a estudar bansuri.

É membro fundador do Ludovice Ensemble e atua regularmente com diversos agrupamentos e orquestras.

Formou-se em traverso com Barthold Kuijken no Conservatório Real da Haia (Países Baixos) e com Linde Brunmayer na Hochschule für Musik em Trossingen (Alemanha); e em flauta de bisel no Conservatório Nacional de Lisboa, e na Haia, com Ricardo Kanji. Joana possui também um mestrado em música, com Marc Hantaï, na Universidade de Aveiro. Gravou vários CDs de música de câmara e a solo.

A sua atividade pedagógica inclui o ensino da flauta e do traverso no Conservatório Nacional de Lisboa.